Mode de vie métabolique de micro-organismes (bactéries, levures, certains protozoaires) se développant et produisant de l’énergie en absence totale (anaérobie stricte) ou partielle (anaérobie facultative) d’oxygène. Les anaérobies stricts utilisent la fermentation ou la respiration anaérobie (accepteurs d’électrons autres que l’oxygène : nitrates, sulfates, CO₂) pour générer de l’ATP. L’oxygène leur est toxique par production de radicaux libres non neutralisables faute d’enzymes protectrices (superoxyde dismutase, catalase). Dans le microbiote intestinal humain, les bactéries anaérobies strictes (Bacteroides, Clostridium, Bifidobacterium) fermentent les fibres alimentaires, produisant des acides gras à chaîne courte (butyrate, propionate, acétate) essentiels à la santé du côlon, l’immunité et le métabolisme. Préserver l’anaérobiose intestinale : fibres prébiotiques, probiotiques, limitation des antibiotiques.
