Écosystème complexe regroupant plus de 100 000 milliards de micro-organismes (bactéries, virus, champignons, archées, protozoaires) colonisant naturellement le tube digestif, principalement le côlon. Ce microbiote joue un rôle physiologique majeur : digestion des fibres, synthèse de vitamines (K, B), régulation immunitaire (70% des cellules immunitaires intestinales), production de neurotransmetteurs (sérotonine) et protection contre les pathogènes. Son déséquilibre (dysbiose) est impliqué dans troubles digestifs, allergies, obésité, dépression. En approche préventive : alimentation riche en fibres prébiotiques, aliments fermentés (probiotiques naturels), limitation des antibiotiques et stress chronique favorisent sa santé et sa diversité.